Osoby fizyczne prowadzące działalność gospodarczą, osoby prawne i ich jednostki organizacyjne oraz jednostki organizacyjne, które dokonują świadczeń z tytułu działalności wykonywanej osobiście, w rozumieniu art. 13 pkt 9 ustawy o PDOF (tj. na podstawie umów o zarządzanie przedsiębiorstwem, kontraktów menedżerskich lub umów o podobnym charakterze), jako płatnicy, są obowiązane pobierać:

• 18% zaliczkę na podatek dochodowy według zasad określonych w art. 41 ust. 1, 1a i 7 ustawy o PDOF lub 18% zryczałtowany podatek dochodowy, o którym mowa w art. 30 ust. 1 pkt 5a ustawy o PDOF - jeżeli menedżer ma miejsce zamieszkania na terytorium Polski, albo
  
  

• 20% zryczałtowany podatek dochodowy określony w art. 29 ust. 1 pkt 1 ustawy o PDOF - jeżeli menedżer nie ma miejsca zamieszkania na terytorium Polski.

Na wniosek podatnika, przy obliczaniu i poborze zaliczki na podatek dochodowy, płatnik może - zamiast stawki 18% - zastosować stawkę 32% (art. 41a ustawy o PDOF).

Pobraną zaliczkę na podatek lub pobrany zryczałtowany podatek płatnik powinien przekazać do 20 dnia następnego miesiąca na rachunek właściwego urzędu skarbowego.

Ponadto, na płatnikach ciążą stosowne obowiązki informacyjne. W zależności od okoliczności faktycznych, będzie to obowiązek sporządzenia imiennej informacji PIT-11 lub IFT-1/IFT-1R, a także deklaracji rocznej PIT-4R lub PIT-8AR.

Wymaga podkreślenia, że fakt wystawiania faktur przez podatnika jako przedsiębiorcę nie stanowi przeszkody dla zakwalifikowania przedmiotowych przychodów do przychodów z działalności wykonywanej osobiście oraz nie zwalnia płatnika od obowiązku pobrania zaliczki.

Wynika to zarówno ze wspomnianej interpretacji ogólnej Ministra Finansów, jak również z orzeczeń sądów administracyjnych oraz z interpretacji indywidualnych organów podatkowych (m.in. Dyrektora Izby Skarbowej w Poznaniu z 16 czerwca 2009 r., nr ILPB1/415-364/09-2/TW i Dyrektora Izby Skarbowej w Bydgoszczy z 30 października 2009 r., nr ITPB1/415-683/09/MM).

Co istotne, jeżeli menedżer jest czynnym podatnikiem VAT (i wystawia faktury VAT), do jego przychodów opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych nie zalicza się należnego podatku od towarów i usług (wynika to z art. 155 ustawy o VAT).
 

Przykład Spółka z o.o. korzysta z usług osób fizycznych, które na podstawie kontraktów menedżerskich świadczą na jej rzecz usługi zarządzania przedsiębiorstwem. Osoby te są polskimi rezydentami i prowadzą działalność gospodarczą w oparciu o wpis do ewidencji działalności gospodarczej. W związku z realizacją kontraktu, każdy z menedżerów wystawia na rzecz spółki z o.o. co miesiąc fakturę VAT na kwotę 10.000 zł + VAT 2.200 zł. W takiej sytuacji przychody uzyskiwane przez menedżerów stanowią przychody z działalności wykonywanej osobiście, o której mowa w art. 13 pkt 9 ustawy o PDOF. Od świadczeń dokonywanych z omawianego tytułu spółka z o.o., jako płatnik, powinna pobierać zaliczki na podatek dochodowy (na zasadach określonych w art. 41 ust. 1, 1a, 7 ustawy o PDOF) w wysokości 18% należności netto (tj. kwoty 10.000 zł), pomniejszonej o zryczałtowane koszty uzyskania przychodów w kwocie 111,25 zł miesięcznie oraz potrącone przez płatnika w danym miesiącu składki na ubezpieczenia społeczne. Obliczoną zaliczkę na podatek zmniejsza się o kwotę składki pobranej przez płatnika na ubezpieczenie zdrowotne (odliczenie nie może jednak przekroczyć 7,75% podstawy wymiaru tej składki). Na spółce z o.o. (tj. na płatniku) ciąży też obowiązek sporządzenia imiennych informacji PIT-11 oraz rocznej deklaracji PIT-4R. Menedżerowie zaś powinni wykazać dochód z kontraktu menedżerskiego w swych rocznych zeznaniach podatkowych (PIT-36 lub PIT-37), w celu opodatkowania według skali podatkowej.