Tak wynika z wyroku WSA w Warszawie z 24 lutego 2010 r., sygn. akt III SA/Wa 1466/09 (orzeczenie nieprawomocne).

W związku z przekształceniem spółki jawnej podatniczka objęła 25% udziałów w spółce z o.o., przy czym majątek spółki jawnej, przeniesiony na spółkę z o.o., był wyższy niż wartość nominalna tego majątku wynikająca z planu przekształcenia. Zadecydował o tym fakt, że między dniem wyceny majątku spółki jawnej a dniem przekształcenia, spółka jawna prowadziła działalność i nabywała majątek.

Podatniczka sprzedała 13,3% udziałów objętych w spółce z o.o., a 11,7% udziałów wniosła aportem do spółki akcyjnej. Jej zdaniem, koszty uzyskania przychodu ze zbycia udziałów na podstawie obu tytułów należało ustalić zgodnie z art. 23 ust. 1 pkt 38 updof, traktując jako koszt wartość bilansową (księgową) spółki jawnej z dnia ustania jej bytu prawnego, będącą jednocześnie wartością bilansową spółki z o.o. z dnia rozpoczęcia tego bytu.

Minister Finansów nie zgodził się ze stanowiskiem podatniczki. W interpretacji indywidualnej stwierdził, że w przypadku przekształcenia spółki osobowej w spółkę kapitałową, gdy cała wartość księgowa nie została przeniesiona na kapitał zakładowy spółki z o.o., w razie zbycia lub wniesienia aportem udziałów, kosztem uzyskania przychodów będzie wartość majątku spółki osobowej do wysokości majątku przekazanego na kapitał spółki kapitałowej (tj. nominalna wartość udziałów w spółce kapitałowej).

Wojewódzki Sąd Administracyjny nie podzielił jednak stanowiska organów podatkowych i wyjaśnił, że metodę, która ma zastosowanie do ustalenia kosztów uzyskania przychodu z odpłatnego zbycia udziałów w spółce kapitałowej, określa art. 30b ust. 2 pkt 4 i 5 updof. Przepisy te odsyłają do art. 22 ust. 1f lub art. 23 ust. 1 pkt 38 updof, jeśli chodzi o przychód ze zbycia udziałów w spółce z o.o., a także do art. 22 ust. 1e updof, jeśli chodzi o przychód z objęcia akcji w spółce akcyjnej w zamian za aport w postaci udziałów w spółce z o.o.

W analizowanej sprawie nie ma zastosowania art. 22 ust. 1f updof, gdyż udziały w przekształconej spółce z o.o., które następnie skarżąca zbyła, zostały objęte w ramach procesu przekształcenia spółek. Tym samym nie zostały one objęte w zamian za wkład niepieniężny.

W tej sytuacji, w ocenie Sądu, niezależnie od tego, czy chodzi o przychód powstający w wyniku sprzedaży udziałów w spółce z o.o., czy też o przychód powstający w wyniku objęcia akcji w spółce akcyjnej w zamian za przekazanie tej spółce udziałów w spółce z o.o., to ustalanie kosztów uzyskania przychodu następuje na podstawie art. 23 ust. 1 pkt 38 updof. Według tego przepisu, wydatki na nabycie udziałów (akcji) są kosztem uzyskania przychodów z odpłatnego zbycia tych udziałów lub akcji.

Sąd podzielił ocenę skarżącej, że zróżnicowanie możliwości odliczenia od przychodu wartości spółki jawnej według tego kryterium, czy całość, czy też część majątku spółki jawnej została przeznaczona na kapitał zakładowy spółki przekształconej, nie znajduje podstaw prawnych. Uznał zatem, że koszty uzyskania przychodu z odpłatnego zbycia udziałów w spółce z o.o. wyznacza wartość środków poniesionych dla uzyskania majątku spółki jawnej, który w dacie ustania bytu prawnego tej spółki, a więc w dacie powstania spółki z o.o., równy był początkowej wartości majątku spółki z o.o. Jak podkreślił WSA, nie istnieje żadna inna metoda, która pozwalałaby wskazać ten koszt, skoro za 25% udziału w spółce jawnej skarżąca otrzymała 25% udziałów w spółce z o.o.