Podatnicy VAT, którzy decydują się na czasowe zawieszenie prowadzonej działalności mają często wątpliwości, czy w okresie zawieszenia działalności mogą rozliczać VAT naliczony z faktur dokumentujących koszty związane z podtrzymaniem tej działalności, takie jak np. leasing operacyjny, energia, telefon, najem lokalu itp.
Brzmienie powołanego przepisu art. 99 ust. 7a ustawy o VAT wskazuje, iż w okresie zawieszenia działalności (poza sytuacjami przedstawionymi w ust. 7b) podatnik nie musi składać deklaracji VAT-7. Nie ma jednak w ustawie zakazu składania deklaracji w okresie zawieszenia działalności.
W związku z tym nie ma przeszkód, aby podatnik, który ponosi w okresie zawieszenia koszty bieżącej działalności, wykazywał w deklaracjach VAT-7 podatek naliczony od tych czynności.
Pamiętać przy tym należy, że na podstawie art. 87 ust. 5a ustawy o VAT, w przypadku gdy w danym okresie rozliczeniowym podatnik nie wykonał czynności opodatkowanych na terytorium kraju oraz czynności wymienionych w art. 86 ust. 8 pkt 1 ustawy o VAT, przysługuje mu zwrot wykazanego w deklaracji podatku naliczonego w terminie 180 dni od dnia złożenia deklaracji. Podstawą zwrotu jest w tym przypadku - oprócz deklaracji - również stosowny wniosek. Jeżeli podatnik złoży zabezpieczenie majątkowe w kwocie żądanego zwrotu, wówczas termin ten może ulec skróceniu do 60 dni od dnia złożenia deklaracji.
Jeżeli podatnik w okresie zawieszenia działalności nie zdecyduje się na składanie deklaracji, w których będzie wykazywał jedynie zakupy i VAT naliczony od ponoszonych kosztów, wówczas - zdaniem redakcji - powinien ewidencjonować te zakupy, a następnie wykazać je zbiorczo jako kwoty uprawniające do odliczenia w pierwszej deklaracji złożonej po wznowieniu działalności. Pozostaje wątpliwość, czy kwoty te powinny zostać wykazane w poz. 47 deklaracji („Kwota nadwyżki z poprzedniej deklaracji”) czy też w poz. 49-50 („Nabycie towarów i usług zaliczanych przez podatnika do środków trwałych”) lub w poz. 51-52 („Nabycie towarów i usług pozostałych”). Ponieważ jednak w analizowanej sytuacji „poprzednie deklaracje” nie były składane, wydaje się, że kwoty podatku naliczonego za okres zawieszenia działalności mogą być wykazywane odpowiednio w poz. 49-50 i 51-52 deklaracji podatkowej.